small RNA是生命活动重要的调控因子，在基因表达调控、生物个体发育、代谢及疾病的发生等生理过程中起着重要的作用,包括miRNA、piRNA和siRNA。
A．miRNA: 是一种长度为21～25nt的单链小分子RNA。它广泛存在于真核生物中，成熟的miRNA是由具发夹结构单链RNA前体（pre miRNA）经过Dicer酶加工而成，主要通过与靶标基因不完全互补结合来调控靶基因的表达。miRNA在细胞发育、生物标志物、肿瘤等多个领域中有广泛的应用。
B. piRNA: 是一类长度为26～31nt单链的小RNA，大部分集中在29～30nt。piRNA的表达具有组织特异性，只存在于具有全能性的动物细胞，如生殖细胞、肿瘤细胞和干细胞等。piRNA通过与Piwi亚家族蛋白结合形成piRNA复合物（piRC）来发挥生物学功能（沉默转录基因过程，维持生殖系和干细胞功能，调节翻译和mRNA的稳定性）。此外，piRNA在一些癌症细胞中存在异常表达的现象，提示piRNA可能参与癌症的发生，并可作为癌症诊断和治疗中的潜在生物标记物。
C. siRNA：内源性干扰小RNA（siRNA, Small interfering RNA），包括ta-siRNA、ra-siRNA和nat-siRNA。ta-siRNA：天然反义转录小干扰RNA，由TAS基因编码，miRNA剪切产生，21nt，作用机制类似于miRNA；ra-siRNA：由重复序列、转座子、异染色质产生，多为24nt；nat-siRNA：由天然反义转录本（序列与同区域互补链上基因的mRNA方向相反且发生部分重叠）产生。siRNA的功能主要与植物胁迫和生物发育相关。

分析流程

生物信息学分析：

去载体后测序质量图

文氏图

分层聚类

网络调控互作图

样品要求
样品类型：细胞、新鲜组织或RNA样品；
样品的量：细胞样品请提供至少1×10⁷个细胞，组织样品请提供至少300mg的组织块或切片，RNA样品请提供2 μg以上的总RNA；
样品质量：RNA无明显降解，提取的总RNA OD260/280值在1.8~2.2之间，浓度≥ 500 ng/μl，28S:18S ≥ 1.5，RIN ≥ 7；
样品保存：细胞样品或新鲜组织块（切成~50mg的小块）可用TRIZOL或RNA保护剂处理或液氮冻存后，-80℃保存，RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中，-80℃保存。样品保存期间避免反复冻融；
样品运输：样品置于1.5 ml管中，封口膜封好，干冰运输。