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转录组测序

转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,包括mRNA和非编码RNA。通过转录组测序,能够全面获得物种特定组织或器官的转录本信息,从而进行转录本结构研究、变异研究、基因表达水平研究以及全新转录本发现等研究。

技术优势
和芯片相比,不仅可检测低丰度的基因表达,更可全面的发现可变剪切、融合基因、RNA编辑等芯片无法检测到的结构变异。

分析流程

 

生物信息学分析:



基因组特征区域测序读数分布情况


基因组比对


可变剪切


火山图


分层聚类


疾病基因关联热图


差异基因互作网络图



GO聚类分析


样品要求

样品类型:细胞、新鲜组织或RNA样品;
样品的量:细胞样品请提供至少1×
107个细胞,组织样品请提供至少300mg的组织块或切片,RNA样品请提供2 μg以上的总RNA;
样品质量:RNA无明显降解,提取的总RNA OD260/280值在1.8~2.2之间,浓度≥ 500 ng/μl,28S:18S ≥ 1.5,RIN ≥ 7;
样品保存:细胞样品或新鲜组织块(切成~50mg的小块)可用TRIZOL或RNA保护剂处理或液氮冻存后,-80℃保存,RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存。样品保存期间避免反复冻融;
样品运输:样品置于1.5 ml管中,封口膜封好,干冰运输。



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